Если вы думаете, что сможете обойтись без этой подсистемы, вы абсолютно правы.
Без регистров правил обойтись можно.

Просто будете заново настраивать все права доступа после очередного обновления. Кое-что типовыми средствами настроить не удастся. Но вам ведь не лень снова зайти в конфигуратор, поставить, где надо, галки, где не надо - снять, переписать в нескольких местах код. Главное - ничего не забыть, кусочки своего кода на всякий случай сохранить куда-нибудь отдельно...

Да, без регистров правил не удастся настроить подстановку реквизитов в документы, да так, чтобы у заданных вами пользователей сами вставали нужные им реквизиты.
В конце-концов, кого они волнуют, эти пользователи? Пусть ручками все поля заполняют. Подумаешь, времени вдвое больше уйдет на формирование каждого документа! Пускай работают, им за это деньги платят!

Да, еще не получится без регистров правил настроить отбор для сотрудников...Это когда сотрудник открывает справочник, а в нем - только "его" контрагенты, или только "его" номенклатура. Но это ведь тоже не страшно? Подумаешь - поищет нужные. Ну, перепутает пару раз, другие в документ подставит. Ерунда какая - найдет ошибку, сделает корректировку. Это же их работа...

И вообще, разве вы ищете легких путей? Ведь было бы слишком просто - взять и настроить все в одном месте. А если изменились пользователи, или требуют изменить им настройки - вы с важным видом всегда сможете открыть конфигуратор, найти нужные строки во всех объектах, снова все переписать...

Регистры правил - это для ленивых. Для тех, кто хочет заставить конфигурацию плясать под свою дудку. Слишком просто, не так ли?